FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa

Occurrence
Последняя версия опубликовано South African National Biodiversity Institute сент. 30, 2020 South African National Biodiversity Institute
Дата публикации:
30 сентября 2020 г.
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 286 Записи в English (9 KB) - Частота обновления: unknown
Метаданные в формате EML Скачать в English (9 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (9 KB)

Описание

The establishment of a database for mushroom pathogens, including establishing a DNA reference library for quick identification.

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 286 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

van der Linde E (2020): FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa. v1.0. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=fbip1&v=1.0

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является South African National Biodiversity Institute. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: c566874c-6163-4098-8778-778fee6fa41f.  South African National Biodiversity Institute отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке South African Biodiversity Information Facility.

Ключевые слова

Occurrence; Specimen

Контакты

Elna van der Linde
  • Metadata Provider
  • Originator
  • Point Of Contact
Manager: Mycology Unit, Biosystematics Programme
Agricultural Research Council, PPRI
Private Bag X134
0121 Queenswood
Gauteng
ZA
+27128088288
Mahlatse Kgatla
  • Distributor
FBIP Data Specialist
SANBI
2 Cussonia Avenue, Brummeria
0184 Pretoria
Gauteng
ZA
0128435196

Географический охват

Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)

Ограничивающие координаты Юг Запад [-90, -180], Север Восток [90, 180]

Таксономический охват

Identification of mushroom pathogens

Kingdom Fungi

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 1929-01-01 / 2011-10-01

Данные проекта

The establishment of a database for mushroom pathogens, including establishing a DNA reference library for quick identification.

Название FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa
Идентификатор IBSG13052418260
Финансирование Foundational Biodiversity Information Programme
Описание района исследования Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)

Исполнители проекта:

Elna van der Linde
  • Principal Investigator

Методы сбора

A comparison between the databases of the UP mushroom research group and PPRI concerning mushroom pathogens was done to identify any isolates that were not yet contained in both collections; these were revived and exchanged. Missing collection data were added as far as possible. The UP database was upgraded by an MSc student who also coordinated plating of cultures for barcoding and addition to the PPRI collection. Each isolate will have data fields containing the following information: o Numbers: PPRI number, UP collection number, any other collection/reference numbers (e.g. in case of foreign specimens) o Identity: genus, species, authors, synonyms o Higher classification: family, order, class etc. o Dates: dates collected, isolated, preserved, deposited o Host / substrate information: host type (= fungus), scientific and common name o Locality details: country, province, town, farm o Collector name, identified by, verified by o Barcoded: Y / N, and barcode reference no. referring to sequence file – to be added For barcoding, the mushroom pathogens (per genus) of the UP collection were plated and checked for viability and purity. This involved plating on required growth media, incubation, checking viability and purity and preservation of voucher cultures under water, under oil, ultra-low freezing as well as freeze drying. The SA isolates were done first, followed by the foreign ones.

Охват исследования Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)
Контроль качества None

Описание этапа методики:

  1. NA

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=fbip1