FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa

Registros biológicos
Última versión publicado por South African National Biodiversity Institute el sept. 30, 2020 South African National Biodiversity Institute
Fecha de publicación:
30 de septiembre de 2020
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

The establishment of a database for mushroom pathogens, including establishing a DNA reference library for quick identification.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 286 registros.

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

van der Linde E (2020): FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa. v1.0. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=fbip1&v=1.0

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es South African National Biodiversity Institute. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: c566874c-6163-4098-8778-778fee6fa41f.  South African National Biodiversity Institute publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por South African Biodiversity Information Facility.

Palabras clave

Occurrence; Specimen

Contactos

Elna van der Linde
  • Proveedor De Los Metadatos ●
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
Manager: Mycology Unit, Biosystematics Programme
Agricultural Research Council, PPRI
Private Bag X134
0121 Queenswood
Gauteng
ZA
+27128088288
Mahlatse Kgatla
  • Distribuidor
FBIP Data Specialist
SANBI
2 Cussonia Avenue, Brummeria
0184 Pretoria
Gauteng
ZA
0128435196
http://fbip.co.za/contact/

Cobertura geográfica

Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-90, -180], Latitud Máxima Longitud Máxima [90, 180]

Cobertura taxonómica

Identification of mushroom pathogens

Reino Fungi

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 1929-01-01 / 2011-10-01

Datos del proyecto

The establishment of a database for mushroom pathogens, including establishing a DNA reference library for quick identification.

Título FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa
Identificador IBSG13052418260
Fuentes de Financiación Foundational Biodiversity Information Programme
Descripción del área de estudio Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)

Personas asociadas al proyecto:

Elna van der Linde
  • Investigador Principal

Métodos de muestreo

A comparison between the databases of the UP mushroom research group and PPRI concerning mushroom pathogens was done to identify any isolates that were not yet contained in both collections; these were revived and exchanged. Missing collection data were added as far as possible. The UP database was upgraded by an MSc student who also coordinated plating of cultures for barcoding and addition to the PPRI collection. Each isolate will have data fields containing the following information: o Numbers: PPRI number, UP collection number, any other collection/reference numbers (e.g. in case of foreign specimens) o Identity: genus, species, authors, synonyms o Higher classification: family, order, class etc. o Dates: dates collected, isolated, preserved, deposited o Host / substrate information: host type (= fungus), scientific and common name o Locality details: country, province, town, farm o Collector name, identified by, verified by o Barcoded: Y / N, and barcode reference no. referring to sequence file – to be added For barcoding, the mushroom pathogens (per genus) of the UP collection were plated and checked for viability and purity. This involved plating on required growth media, incubation, checking viability and purity and preservation of voucher cultures under water, under oil, ultra-low freezing as well as freeze drying. The SA isolates were done first, followed by the foreign ones.

Área de Estudio Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)
Control de Calidad None

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. NA

Metadatos adicionales