FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa

オカレンス(観察データと標本)
最新バージョン South African National Biodiversity Institute により出版 9月 30, 2020 South African National Biodiversity Institute
公開日:
2020年9月30日
ライセンス:
CC-BY 4.0

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード:

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 286 レコード English で (9 KB) - 更新頻度: unknown
EML ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (9 KB)
RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (9 KB)

説明

The establishment of a database for mushroom pathogens, including establishing a DNA reference library for quick identification.

データ レコード

この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、286 レコードが含まれています。

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

van der Linde E (2020): FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa. v1.0. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=fbip1&v=1.0

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は South African National Biodiversity Institute。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: c566874c-6163-4098-8778-778fee6fa41fが割り当てられています。   South African Biodiversity Information Facility によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているSouth African National Biodiversity Institute が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence; Specimen

連絡先

Elna van der Linde
  • メタデータ提供者
  • 最初のデータ採集者
  • 連絡先
Manager: Mycology Unit, Biosystematics Programme
Agricultural Research Council, PPRI
Private Bag X134
0121 Queenswood
Gauteng
ZA
+27128088288
Mahlatse Kgatla
  • データ配布者
FBIP Data Specialist
SANBI
2 Cussonia Avenue, Brummeria
0184 Pretoria
Gauteng
ZA
0128435196

地理的範囲

Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)

座標(緯度経度) 南 西 [-90, -180], 北 東 [90, 180]

生物分類学的範囲

Identification of mushroom pathogens

Kingdom Fungi

時間的範囲

開始日 / 終了日 1929-01-01 / 2011-10-01

プロジェクトデータ

The establishment of a database for mushroom pathogens, including establishing a DNA reference library for quick identification.

タイトル FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa
識別子 IBSG13052418260
ファンデイング Foundational Biodiversity Information Programme
Study Area Description Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)

プロジェクトに携わる要員:

Elna van der Linde
  • 研究代表者

収集方法

A comparison between the databases of the UP mushroom research group and PPRI concerning mushroom pathogens was done to identify any isolates that were not yet contained in both collections; these were revived and exchanged. Missing collection data were added as far as possible. The UP database was upgraded by an MSc student who also coordinated plating of cultures for barcoding and addition to the PPRI collection. Each isolate will have data fields containing the following information: o Numbers: PPRI number, UP collection number, any other collection/reference numbers (e.g. in case of foreign specimens) o Identity: genus, species, authors, synonyms o Higher classification: family, order, class etc. o Dates: dates collected, isolated, preserved, deposited o Host / substrate information: host type (= fungus), scientific and common name o Locality details: country, province, town, farm o Collector name, identified by, verified by o Barcoded: Y / N, and barcode reference no. referring to sequence file – to be added For barcoding, the mushroom pathogens (per genus) of the UP collection were plated and checked for viability and purity. This involved plating on required growth media, incubation, checking viability and purity and preservation of voucher cultures under water, under oil, ultra-low freezing as well as freeze drying. The SA isolates were done first, followed by the foreign ones.

Study Extent Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)
Quality Control None

Method step description:

  1. NA

追加のメタデータ