Ocorrência

FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa

Versão mais recente publicado por South African National Biodiversity Institute em 30 de Setembro de 2020 South African National Biodiversity Institute
The establishment of a database for mushroom pathogens, including establishing a DNA reference library for quick identification.
Publication date:
30 de Setembro de 2020
License:
CC-BY 4.0

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 286 registros.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Downloads

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Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

van der Linde E (2020): FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa. v1.0. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=fbip1&v=1.0

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é South African National Biodiversity Institute. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: c566874c-6163-4098-8778-778fee6fa41f.  South African National Biodiversity Institute publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por South African Biodiversity Information Facility.

Palavras-chave

Occurrence; Specimen

Contatos

Quem criou esse recurso:

Elna van der Linde
Manager: Mycology Unit, Biosystematics Programme
Agricultural Research Council, PPRI
Private Bag X134
0121 Queenswood
Gauteng
ZA
+27128088288

Quem pode responder a perguntas sobre o recurso:

Elna van der Linde
Manager: Mycology Unit, Biosystematics Programme
Agricultural Research Council, PPRI
Private Bag X134
0121 Queenswood
Gauteng
ZA
+27128088288

Quem preencher os metadados:

Elna van der Linde
Manager: Mycology Unit, Biosystematics Programme
Agricultural Research Council, PPRI
Private Bag X134
0121 Queenswood
Gauteng
ZA
+27128088288

Quem mais foi associado com o recurso:

Distribuidor
Mahlatse Kgatla
FBIP Data Specialist
SANBI
2 Cussonia Avenue, Brummeria
0184 Pretoria
Gauteng
ZA
0128435196
http://fbip.co.za/contact/

Cobertura Geográfica

Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-90, -180], Norte Leste [90, 180]

Cobertura Taxonômica

Identification of mushroom pathogens

Reino  Fungi

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 1929-01-01 / 2011-10-01

Dados Sobre o Projeto

The establishment of a database for mushroom pathogens, including establishing a DNA reference library for quick identification.

Título FBIP: Establishment of a fully data-based and barcoded collection of mushroom pathogens for South Africa
Identificador IBSG13052418260
Financiamento Foundational Biodiversity Information Programme
Descrição da Área de Estudo Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)

O pessoal envolvido no projeto:

Pesquisador Principal
Elna van der Linde

Métodos de Amostragem

A comparison between the databases of the UP mushroom research group and PPRI concerning mushroom pathogens was done to identify any isolates that were not yet contained in both collections; these were revived and exchanged. Missing collection data were added as far as possible. The UP database was upgraded by an MSc student who also coordinated plating of cultures for barcoding and addition to the PPRI collection. Each isolate will have data fields containing the following information: o Numbers: PPRI number, UP collection number, any other collection/reference numbers (e.g. in case of foreign specimens) o Identity: genus, species, authors, synonyms o Higher classification: family, order, class etc. o Dates: dates collected, isolated, preserved, deposited o Host / substrate information: host type (= fungus), scientific and common name o Locality details: country, province, town, farm o Collector name, identified by, verified by o Barcoded: Y / N, and barcode reference no. referring to sequence file – to be added For barcoding, the mushroom pathogens (per genus) of the UP collection were plated and checked for viability and purity. This involved plating on required growth media, incubation, checking viability and purity and preservation of voucher cultures under water, under oil, ultra-low freezing as well as freeze drying. The SA isolates were done first, followed by the foreign ones.

Área de Estudo Global (Australia, Belgium, Canada, Denmark, France, Germany, Ireland, Ireland, Netherlands, New Zealand, Poland, RSA, The Netherlands, UK, USA)
Controle de Qualidade None

Descrição dos passos do método:

  1. NA

Metadados Adicionais