説明
Survey of Rutaceae species of the fynbos area. Additional data, will help provide abundance lists, distribution and locality of these plants, while the molecular means to identify the species.
データ レコード
この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、834 レコードが含まれています。
この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。
バージョン
次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。
引用方法
研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:
Pietersen G (2020): FBIP: Taxonomy and Candidatus Liberibacter status of South African Buchu plants. v1.1. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=taxonomy&v=1.1
権利
研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:
パブリッシャーとライセンス保持者権利者は South African National Biodiversity Institute。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.
GBIF登録
このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 065c4d4a-eead-44a4-ac94-19df2a0a47adが割り当てられています。 South African Biodiversity Information Facility によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているSouth African National Biodiversity Institute が、このリソースをパブリッシュしました。
キーワード
Occurrence; Specimen
連絡先
- メタデータ提供者 ●
- 最初のデータ採集者 ●
- 連絡先
- データ提供者
地理的範囲
South Africa (Western Cape, Kwa-Zulu Natal)
| 座標（緯度経度） | 南 西 [-34.778, 17.71], 北 東 [-26.746, 33.223] |
|---|
生物分類学的範囲
Family: Rutaceae
| Family | Rutaceae (Buchus Plants) |
|---|
時間的範囲
| 開始日 / 終了日 | 2014-10-16 / 2018-01-12 |
|---|
プロジェクトデータ
Survey of Rutaceae species of the fynbos area. Additional data, will help provide abundance lists, distribution and locality of these plants, while the molecular means to identify the species.
| タイトル | Taxonomy and Candidatus Liberibacter status of South African Buchu plants |
|---|---|
| 識別子 | FBIS150609119002 |
| ファンデイング | Foundational Biodiversity Information Programme |
| Study Area Description | South Africa (Western Cape, Kwa-Zulu Natal) |
プロジェクトに携わる要員:
- 研究代表者
収集方法
Leaves were collected
| Study Extent | South Africa (Western Cape, Kwa-Zulu Natal) |
|---|
Method step description:
- 1) We plan to collect and sequence barcoding genes of known, morphologically identified specimens of buchu collected under permit at Kirstenbosch botanical gardens or from herbarium specimens where permission is granted to do so. Collection from live plants will not be destructive as only about 5g fresh weight of leaf material is required in order to obtain phloem tissue (to which the Ca. Liberibacters are confined). 2) We will collect leaf material from large numbers of buchu specimens (we plan to collect a total of about 1000 specimens in total, with between 10 and 20 replicates of visually identified species of “buchu” (in the broadest sense) from randomly selected transects from three Western Cape nature reserves containing the greatest diversity of buchu, and where permits for the study can be obtained. This will be done in the flowering season of two successive years. All samples obtained will be assigned a unique accession number and the following data will be recorded for each specimen: date of collection, collector details, photographs of the plant and any distinguishing feature(s), plant visual identification, locality data, the exact location (to an accuracy of 0.25m determined by a differential GPS) and the habitat description. 3) Collected material will be archived in the South African Plant Virus culture collection (SAPVC) at ARC-PPRI, as desiccated plant material as well as in -80oC freezer storage, and voucher specimens for identification purposes submitted to the Compton Herbarium (NBG) and National Herbarium (PRE). 5) All samples will be tested for Ca. Liberibacter using a generic Ca. Liberibacter PCR developed in our laboratory (Pietersen, unpublished), based on all known Ca. Liberibacter sequences. 6) All Liberibacter infected samples (as determined by real-time PCR) will be tested with primers to specific Liberibacters (Ca. Liberibacter -americanus, -africanus, - asiaticus, -solanacearum and -africanus subspecies –capensis, -verpidis, -clausenae, -zanthoxyli, and –tecleae) in conventional PCR’s or a newly developed multiplex PCR capable of detecting these (Roberts unpublished results). 7) All plant samples, irrespective of Ca. Liberibacter status, will be subjected to barcoding PCR’s (rbcL, matK, trnH/psb) and the amplicons sequenced by Sanger sequencing.