Descripción
Survey of Rutaceae species of the fynbos area. Additional data, will help provide abundance lists, distribution and locality of these plants, while the molecular means to identify the species.
Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 834 registros.
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Versiones
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¿Cómo referenciar?
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Pietersen G (2020): FBIP: Taxonomy and Candidatus Liberibacter status of South African Buchu plants. v1.1. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=taxonomy&v=1.1
Derechos
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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es South African National Biodiversity Institute. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 065c4d4a-eead-44a4-ac94-19df2a0a47ad. South African National Biodiversity Institute publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por South African Biodiversity Information Facility.
Palabras clave
Occurrence; Specimen
Contactos
- Proveedor De Los Metadatos ●
- Originador ●
- Punto De Contacto
- Proveedor De Contenido
Cobertura geográfica
South Africa (Western Cape, Kwa-Zulu Natal)
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [-34,778, 17,71], Latitud Máxima Longitud Máxima [-26,746, 33,223] |
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Cobertura taxonómica
Family: Rutaceae
| Familia | Rutaceae (Buchus Plants) |
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Cobertura temporal
| Fecha Inicial / Fecha Final | 2014-10-16 / 2018-01-12 |
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Datos del proyecto
Survey of Rutaceae species of the fynbos area. Additional data, will help provide abundance lists, distribution and locality of these plants, while the molecular means to identify the species.
| Título | Taxonomy and Candidatus Liberibacter status of South African Buchu plants |
|---|---|
| Identificador | FBIS150609119002 |
| Fuentes de Financiación | Foundational Biodiversity Information Programme |
| Descripción del área de estudio | South Africa (Western Cape, Kwa-Zulu Natal) |
Personas asociadas al proyecto:
- Investigador Principal
Métodos de muestreo
Leaves were collected
| Área de Estudio | South Africa (Western Cape, Kwa-Zulu Natal) |
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Descripción de la metodología paso a paso:
- 1) We plan to collect and sequence barcoding genes of known, morphologically identified specimens of buchu collected under permit at Kirstenbosch botanical gardens or from herbarium specimens where permission is granted to do so. Collection from live plants will not be destructive as only about 5g fresh weight of leaf material is required in order to obtain phloem tissue (to which the Ca. Liberibacters are confined). 2) We will collect leaf material from large numbers of buchu specimens (we plan to collect a total of about 1000 specimens in total, with between 10 and 20 replicates of visually identified species of “buchu” (in the broadest sense) from randomly selected transects from three Western Cape nature reserves containing the greatest diversity of buchu, and where permits for the study can be obtained. This will be done in the flowering season of two successive years. All samples obtained will be assigned a unique accession number and the following data will be recorded for each specimen: date of collection, collector details, photographs of the plant and any distinguishing feature(s), plant visual identification, locality data, the exact location (to an accuracy of 0.25m determined by a differential GPS) and the habitat description. 3) Collected material will be archived in the South African Plant Virus culture collection (SAPVC) at ARC-PPRI, as desiccated plant material as well as in -80oC freezer storage, and voucher specimens for identification purposes submitted to the Compton Herbarium (NBG) and National Herbarium (PRE). 5) All samples will be tested for Ca. Liberibacter using a generic Ca. Liberibacter PCR developed in our laboratory (Pietersen, unpublished), based on all known Ca. Liberibacter sequences. 6) All Liberibacter infected samples (as determined by real-time PCR) will be tested with primers to specific Liberibacters (Ca. Liberibacter -americanus, -africanus, - asiaticus, -solanacearum and -africanus subspecies –capensis, -verpidis, -clausenae, -zanthoxyli, and –tecleae) in conventional PCR’s or a newly developed multiplex PCR capable of detecting these (Roberts unpublished results). 7) All plant samples, irrespective of Ca. Liberibacter status, will be subjected to barcoding PCR’s (rbcL, matK, trnH/psb) and the amplicons sequenced by Sanger sequencing.
Metadatos adicionales
| Identificadores alternativos | http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=taxonomy |
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