Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 834 enregistrements.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Téléchargements
Téléchargez la dernière version de la ressource en tant qu'Archive Darwin Core (DwC-A), ou les métadonnées de la ressource au format EML ou RTF :
| Données sous forme de fichier DwC-A (zip) | télécharger 834 enregistrements dans Anglais (16 kB) - Fréquence de mise à jour: inconnue |
|---|---|
| Métadonnées sous forme de fichier EML | télécharger dans Anglais (10 kB) |
| Métadonnées sous forme de fichier RTF | télécharger dans Anglais (10 kB) |
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Pietersen G (2020): FBIP: Taxonomy and Candidatus Liberibacter status of South African Buchu plants. v1.1. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=taxonomy&v=1.1
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est South African National Biodiversity Institute. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 065c4d4a-eead-44a4-ac94-19df2a0a47ad. South African National Biodiversity Institute publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du South African Biodiversity Information Facility.
Mots-clé
Occurrence; Specimen
Contacts
Personne ayant créé cette ressource:
Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:
Personne ayant renseigné les métadonnées:
Autres personnes associées à la ressource:
Couverture géographique
South Africa (Western Cape, Kwa-Zulu Natal)
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [-34,778, 17,71], Nord Est [-26,746, 33,223] |
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Couverture taxonomique
Family: Rutaceae
| Family | Rutaceae (Buchus Plants) |
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Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 2014-10-16 / 2018-01-12 |
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Données sur le projet
Survey of Rutaceae species of the fynbos area. Additional data, will help provide abundance lists, distribution and locality of these plants, while the molecular means to identify the species.
| Titre | Taxonomy and Candidatus Liberibacter status of South African Buchu plants |
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| Identifiant | FBIS150609119002 |
| Financement | Foundational Biodiversity Information Programme |
| Description du domaine d'étude / de recherche | South Africa (Western Cape, Kwa-Zulu Natal) |
Les personnes impliquées dans le projet:
Méthodes d'échantillonnage
Leaves were collected
| Etendue de l'étude | South Africa (Western Cape, Kwa-Zulu Natal) |
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Description des étapes de la méthode:
- 1) We plan to collect and sequence barcoding genes of known, morphologically identified specimens of buchu collected under permit at Kirstenbosch botanical gardens or from herbarium specimens where permission is granted to do so. Collection from live plants will not be destructive as only about 5g fresh weight of leaf material is required in order to obtain phloem tissue (to which the Ca. Liberibacters are confined). 2) We will collect leaf material from large numbers of buchu specimens (we plan to collect a total of about 1000 specimens in total, with between 10 and 20 replicates of visually identified species of “buchu” (in the broadest sense) from randomly selected transects from three Western Cape nature reserves containing the greatest diversity of buchu, and where permits for the study can be obtained. This will be done in the flowering season of two successive years. All samples obtained will be assigned a unique accession number and the following data will be recorded for each specimen: date of collection, collector details, photographs of the plant and any distinguishing feature(s), plant visual identification, locality data, the exact location (to an accuracy of 0.25m determined by a differential GPS) and the habitat description. 3) Collected material will be archived in the South African Plant Virus culture collection (SAPVC) at ARC-PPRI, as desiccated plant material as well as in -80oC freezer storage, and voucher specimens for identification purposes submitted to the Compton Herbarium (NBG) and National Herbarium (PRE). 5) All samples will be tested for Ca. Liberibacter using a generic Ca. Liberibacter PCR developed in our laboratory (Pietersen, unpublished), based on all known Ca. Liberibacter sequences. 6) All Liberibacter infected samples (as determined by real-time PCR) will be tested with primers to specific Liberibacters (Ca. Liberibacter -americanus, -africanus, - asiaticus, -solanacearum and -africanus subspecies –capensis, -verpidis, -clausenae, -zanthoxyli, and –tecleae) in conventional PCR’s or a newly developed multiplex PCR capable of detecting these (Roberts unpublished results). 7) All plant samples, irrespective of Ca. Liberibacter status, will be subjected to barcoding PCR’s (rbcL, matK, trnH/psb) and the amplicons sequenced by Sanger sequencing.
Métadonnées additionnelles
| Identifiants alternatifs | http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=taxonomy |
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