FBIP: Mycorrhizal associations of Erica hair roots in South African fynbos

Occurrence
Последняя версия опубликовано South African National Biodiversity Institute дек. 5, 2019 South African National Biodiversity Institute
Дата публикации:
5 декабря 2019 г.
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 193 Записи в English (9 KB) - Частота обновления: неизвестно
Метаданные в формате EML Скачать в English (8 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (9 KB)

Описание

Ericoid mycorrhizae (ERM) form between a range of fungal symbionts and the hair roots of ericaceous plants. This data set includes the fungal symbionts that were identified from root hairs of Erica mammosa and Erica versicolor. The diversity of the symbionts were examined using both cloning and sequencing and automated ribosomal intergenic spacer analysis (ARISA). The data represent the collection details for the Ericas, as well as sequence reference and catalogue numbers for the isolates which are housed in the Microbiology Department of Stellenbosch University.

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 193 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Jacobs, K. Mycorrhizal associations of Erica hair roots in South African fynbos - data set

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является South African National Biodiversity Institute. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 417276eb-5082-4da3-b410-fe5680da65d9.  South African National Biodiversity Institute отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке South African Biodiversity Information Facility.

Ключевые слова

Occurrence; Specimen

Контакты

Karin Jacobs
  • Originator ●
  • Point Of Contact
Professor
Stellenbosch University
Department of Microbiology, University of Stellenbosch.Private Bag X1, Matieland.
7600 Stellenbosch
Western Cape
ZA
021-8085806
Fhatani Ranwashe
  • Metadata Provider
Data Technician
South African National Biodiversity Institute
SANBI Private Bag X7, Kirstenbosch 7735 Claremont Western Cape ZA
7735 Cape Town
Western Cape
ZA
021 799 8738
http://www.sanbi.org/

Географический охват

Western Cape: City of Cape Town, Helderberg Nature Reserve; Stellenbosch, Jonkershoek Nature Reserve; Swartland, Riverlands-Pella research station

Ограничивающие координаты Юг Запад [-34,061, 18,572], Север Восток [-33,487, 18,98]

Таксономический охват

Fungi, Ascomycetes, Basidiomycetes associated with Erica mammosa and Erica versicolor roots. Data set includes details of collection of Erica mammosa and Erica versicolor and of the isolates, with reference for sequence data. Several isolates unidentified, or identified as new species. Genera included: Calcarisporiella, Cryptococcus, Cryptosporiopsis, Fusarium, Leohumicola, Oidiodendron, Penicillium, Sporobolomyces, Sporothrix

Phylum Fungi, Ascomycetes, Basidiomycetes, Erica mammosa, Erica versicolor (Fungi)

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2010-03-18 / 2013-01-31

Методы сбора

ARISA (Automated ribosomal intergenic spacer analysis) analysis was done on a number of roots from a variety of fynbos sites, and data comparisons were done to compare the endophytic community both within different regions of root systems, between individual plants, and between different nature reserves, to determine if any significant patterns of association exist.

Охват исследования Western Cape: City of Cape Town, Helderberg Nature Reserve; Stellenbosch, Jonkershoek Nature Reserve; Swartland, Riverlands-Pella research station
Контроль качества No data verification or cleaning done. Co-ordinates for some samples are in deg,min,sec and others for deg,decimal mins (highlighted). Probable error in format for some of the latitudes - stated as seconds rather than minutes.

Описание этапа методики:

  1. The data includes endophytes isolated from Erica mammosa roots which were cultured, and then DNA was extracted and sequenced.

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=mycorrhizal_associations_erica_fynbos