FBIP: Mycorrhizal associations of Erica hair roots in South African fynbos

Occurrence
Dernière version Publié par South African National Biodiversity Institute le déc. 5, 2019 South African National Biodiversity Institute
Date de publication:
5 décembre 2019
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

Ericoid mycorrhizae (ERM) form between a range of fungal symbionts and the hair roots of ericaceous plants. This data set includes the fungal symbionts that were identified from root hairs of Erica mammosa and Erica versicolor. The diversity of the symbionts were examined using both cloning and sequencing and automated ribosomal intergenic spacer analysis (ARISA). The data represent the collection details for the Ericas, as well as sequence reference and catalogue numbers for the isolates which are housed in the Microbiology Department of Stellenbosch University.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 193 enregistrements.

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

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Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Jacobs, K. Mycorrhizal associations of Erica hair roots in South African fynbos - data set

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est South African National Biodiversity Institute. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 417276eb-5082-4da3-b410-fe5680da65d9.  South African National Biodiversity Institute publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du South African Biodiversity Information Facility.

Mots-clé

Occurrence; Specimen

Contacts

Karin Jacobs
  • Créateur ●
  • Personne De Contact
Professor
Stellenbosch University
Department of Microbiology, University of Stellenbosch.Private Bag X1, Matieland.
7600 Stellenbosch
Western Cape
ZA
021-8085806
Fhatani Ranwashe
  • Fournisseur Des Métadonnées
Data Technician
South African National Biodiversity Institute
SANBI Private Bag X7, Kirstenbosch 7735 Claremont Western Cape ZA
7735 Cape Town
Western Cape
ZA
021 799 8738
http://www.sanbi.org/

Couverture géographique

Western Cape: City of Cape Town, Helderberg Nature Reserve; Stellenbosch, Jonkershoek Nature Reserve; Swartland, Riverlands-Pella research station

Enveloppe géographique Sud Ouest [-34,061, 18,572], Nord Est [-33,487, 18,98]

Couverture taxonomique

Fungi, Ascomycetes, Basidiomycetes associated with Erica mammosa and Erica versicolor roots. Data set includes details of collection of Erica mammosa and Erica versicolor and of the isolates, with reference for sequence data. Several isolates unidentified, or identified as new species. Genera included: Calcarisporiella, Cryptococcus, Cryptosporiopsis, Fusarium, Leohumicola, Oidiodendron, Penicillium, Sporobolomyces, Sporothrix

Phylum Fungi, Ascomycetes, Basidiomycetes, Erica mammosa, Erica versicolor (Fungi)

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2010-03-18 / 2013-01-31

Méthodes d'échantillonnage

ARISA (Automated ribosomal intergenic spacer analysis) analysis was done on a number of roots from a variety of fynbos sites, and data comparisons were done to compare the endophytic community both within different regions of root systems, between individual plants, and between different nature reserves, to determine if any significant patterns of association exist.

Etendue de l'étude Western Cape: City of Cape Town, Helderberg Nature Reserve; Stellenbosch, Jonkershoek Nature Reserve; Swartland, Riverlands-Pella research station
Contrôle qualité No data verification or cleaning done. Co-ordinates for some samples are in deg,min,sec and others for deg,decimal mins (highlighted). Probable error in format for some of the latitudes - stated as seconds rather than minutes.

Description des étapes de la méthode:

  1. The data includes endophytes isolated from Erica mammosa roots which were cultured, and then DNA was extracted and sequenced.

Métadonnées additionnelles