FBIP: Mycorrhizal associations of Erica hair roots in South African fynbos

Ocorrência
Versão mais recente published by South African National Biodiversity Institute on dez 5, 2019 South African National Biodiversity Institute
Publication date:
5 de dezembro de 2019
Licença:
CC-BY 4.0

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Descrição

Ericoid mycorrhizae (ERM) form between a range of fungal symbionts and the hair roots of ericaceous plants. This data set includes the fungal symbionts that were identified from root hairs of Erica mammosa and Erica versicolor. The diversity of the symbionts were examined using both cloning and sequencing and automated ribosomal intergenic spacer analysis (ARISA). The data represent the collection details for the Ericas, as well as sequence reference and catalogue numbers for the isolates which are housed in the Microbiology Department of Stellenbosch University.

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 193 registros.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Jacobs, K. Mycorrhizal associations of Erica hair roots in South African fynbos - data set

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é South African National Biodiversity Institute. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 417276eb-5082-4da3-b410-fe5680da65d9.  South African National Biodiversity Institute publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por South African Biodiversity Information Facility.

Palavras-chave

Occurrence; Specimen

Contatos

Karin Jacobs
  • Originador ●
  • Ponto De Contato
Professor
Stellenbosch University
Department of Microbiology, University of Stellenbosch.Private Bag X1, Matieland.
7600 Stellenbosch
Western Cape
ZA
021-8085806
Fhatani Ranwashe
  • Provedor Dos Metadados
Data Technician
South African National Biodiversity Institute
SANBI Private Bag X7, Kirstenbosch 7735 Claremont Western Cape ZA
7735 Cape Town
Western Cape
ZA
021 799 8738
http://www.sanbi.org/

Cobertura Geográfica

Western Cape: City of Cape Town, Helderberg Nature Reserve; Stellenbosch, Jonkershoek Nature Reserve; Swartland, Riverlands-Pella research station

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-34,061, 18,572], Norte Leste [-33,487, 18,98]

Cobertura Taxonômica

Fungi, Ascomycetes, Basidiomycetes associated with Erica mammosa and Erica versicolor roots. Data set includes details of collection of Erica mammosa and Erica versicolor and of the isolates, with reference for sequence data. Several isolates unidentified, or identified as new species. Genera included: Calcarisporiella, Cryptococcus, Cryptosporiopsis, Fusarium, Leohumicola, Oidiodendron, Penicillium, Sporobolomyces, Sporothrix

Filo Fungi, Ascomycetes, Basidiomycetes, Erica mammosa, Erica versicolor (Fungi)

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 2010-03-18 / 2013-01-31

Métodos de Amostragem

ARISA (Automated ribosomal intergenic spacer analysis) analysis was done on a number of roots from a variety of fynbos sites, and data comparisons were done to compare the endophytic community both within different regions of root systems, between individual plants, and between different nature reserves, to determine if any significant patterns of association exist.

Área de Estudo Western Cape: City of Cape Town, Helderberg Nature Reserve; Stellenbosch, Jonkershoek Nature Reserve; Swartland, Riverlands-Pella research station
Controle de Qualidade No data verification or cleaning done. Co-ordinates for some samples are in deg,min,sec and others for deg,decimal mins (highlighted). Probable error in format for some of the latitudes - stated as seconds rather than minutes.

Descrição dos passos do método:

  1. The data includes endophytes isolated from Erica mammosa roots which were cultured, and then DNA was extracted and sequenced.