Registros biológicos

FBIP: Mycorrhizal associations of Erica hair roots in South African fynbos

Última versión Publicado por South African National Biodiversity Institute en 5 de diciembre de 2019 South African National Biodiversity Institute
Ericoid mycorrhizae (ERM) form between a range of fungal symbionts and the hair roots of ericaceous plants. This data set includes the fungal symbionts that were identified from root hairs of Erica mammosa and Erica versicolor. The diversity of the symbionts were examined using both cloning and sequencing and automated ribosomal intergenic spacer analysis (ARISA). The data represent the collection details for the Ericas, as well as sequence reference and catalogue numbers for the isolates which are housed in the Microbiology Department of Stellenbosch University.
Fecha de publicación:
5 de diciembre de 2019
Licencia:
CC-BY 4.0

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 193 registros.

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Versiones

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Jacobs, K. Mycorrhizal associations of Erica hair roots in South African fynbos - data set

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es South African National Biodiversity Institute. Este trabajo está autorizado bajo una Licencia Creative Commons Atribución/Reconocimiento 4.0 Internacional (CC-BY) 4.0.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 417276eb-5082-4da3-b410-fe5680da65d9.  South African National Biodiversity Institute publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por South African Biodiversity Information Facility.

Palabras clave

Occurrence; Specimen

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Karin Jacobs
Professor
Stellenbosch University
Department of Microbiology, University of Stellenbosch.Private Bag X1, Matieland.
7600 Stellenbosch
Western Cape
ZA
021-8085806

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Karin Jacobs
Professor
Stellenbosch University
Department of Microbiology, University of Stellenbosch.Private Bag X1, Matieland.
7600 Stellenbosch
Western Cape
ZA
021-8085806

¿Quién documentó los metadatos?:

Fhatani Ranwashe
Data Technician
South African National Biodiversity Institute
SANBI Private Bag X7, Kirstenbosch 7735 Claremont Western Cape ZA
7735 Cape Town
Western Cape
ZA
021 799 8738
http://www.sanbi.org/

Cobertura geográfica

Western Cape: City of Cape Town, Helderberg Nature Reserve; Stellenbosch, Jonkershoek Nature Reserve; Swartland, Riverlands-Pella research station

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-34,061, 18,572], Latitud Máxima Longitud Máxima [-33,487, 18,98]

Cobertura taxonómica

Fungi, Ascomycetes, Basidiomycetes associated with Erica mammosa and Erica versicolor roots. Data set includes details of collection of Erica mammosa and Erica versicolor and of the isolates, with reference for sequence data. Several isolates unidentified, or identified as new species. Genera included: Calcarisporiella, Cryptococcus, Cryptosporiopsis, Fusarium, Leohumicola, Oidiodendron, Penicillium, Sporobolomyces, Sporothrix

Filo  Fungi, Ascomycetes, Basidiomycetes, Erica mammosa, Erica versicolor (Fungi)

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2010-03-18 / 2013-01-31

Métodos de muestreo

ARISA (Automated ribosomal intergenic spacer analysis) analysis was done on a number of roots from a variety of fynbos sites, and data comparisons were done to compare the endophytic community both within different regions of root systems, between individual plants, and between different nature reserves, to determine if any significant patterns of association exist.

Área de Estudio Western Cape: City of Cape Town, Helderberg Nature Reserve; Stellenbosch, Jonkershoek Nature Reserve; Swartland, Riverlands-Pella research station
Control de Calidad No data verification or cleaning done. Co-ordinates for some samples are in deg,min,sec and others for deg,decimal mins (highlighted). Probable error in format for some of the latitudes - stated as seconds rather than minutes.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. The data includes endophytes isolated from Erica mammosa roots which were cultured, and then DNA was extracted and sequenced.