FBIP: Mycorrhizal associations of Erica hair roots in South African fynbos

Registros biológicos
Última versión publicado por South African National Biodiversity Institute el dic. 5, 2019 South African National Biodiversity Institute
Fecha de publicación:
5 de diciembre de 2019
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

Ericoid mycorrhizae (ERM) form between a range of fungal symbionts and the hair roots of ericaceous plants. This data set includes the fungal symbionts that were identified from root hairs of Erica mammosa and Erica versicolor. The diversity of the symbionts were examined using both cloning and sequencing and automated ribosomal intergenic spacer analysis (ARISA). The data represent the collection details for the Ericas, as well as sequence reference and catalogue numbers for the isolates which are housed in the Microbiology Department of Stellenbosch University.

Registros

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Versiones

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Jacobs, K. Mycorrhizal associations of Erica hair roots in South African fynbos - data set

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es South African National Biodiversity Institute. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 417276eb-5082-4da3-b410-fe5680da65d9.  South African National Biodiversity Institute publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por South African Biodiversity Information Facility.

Palabras clave

Occurrence; Specimen

Contactos

Karin Jacobs
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
Professor
Stellenbosch University
Department of Microbiology, University of Stellenbosch.Private Bag X1, Matieland.
7600 Stellenbosch
Western Cape
ZA
021-8085806
Fhatani Ranwashe
  • Proveedor De Los Metadatos
Data Technician
South African National Biodiversity Institute
SANBI Private Bag X7, Kirstenbosch 7735 Claremont Western Cape ZA
7735 Cape Town
Western Cape
ZA
021 799 8738
http://www.sanbi.org/

Cobertura geográfica

Western Cape: City of Cape Town, Helderberg Nature Reserve; Stellenbosch, Jonkershoek Nature Reserve; Swartland, Riverlands-Pella research station

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-34,061, 18,572], Latitud Máxima Longitud Máxima [-33,487, 18,98]

Cobertura taxonómica

Fungi, Ascomycetes, Basidiomycetes associated with Erica mammosa and Erica versicolor roots. Data set includes details of collection of Erica mammosa and Erica versicolor and of the isolates, with reference for sequence data. Several isolates unidentified, or identified as new species. Genera included: Calcarisporiella, Cryptococcus, Cryptosporiopsis, Fusarium, Leohumicola, Oidiodendron, Penicillium, Sporobolomyces, Sporothrix

Filo Fungi, Ascomycetes, Basidiomycetes, Erica mammosa, Erica versicolor (Fungi)

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2010-03-18 / 2013-01-31

Métodos de muestreo

ARISA (Automated ribosomal intergenic spacer analysis) analysis was done on a number of roots from a variety of fynbos sites, and data comparisons were done to compare the endophytic community both within different regions of root systems, between individual plants, and between different nature reserves, to determine if any significant patterns of association exist.

Área de Estudio Western Cape: City of Cape Town, Helderberg Nature Reserve; Stellenbosch, Jonkershoek Nature Reserve; Swartland, Riverlands-Pella research station
Control de Calidad No data verification or cleaning done. Co-ordinates for some samples are in deg,min,sec and others for deg,decimal mins (highlighted). Probable error in format for some of the latitudes - stated as seconds rather than minutes.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. The data includes endophytes isolated from Erica mammosa roots which were cultured, and then DNA was extracted and sequenced.