Occurrence

FBIP: Genetic diversity of olive insect pests and their natural enemies in the Western Cape

Последняя версия опубликована South African National Biodiversity Institute 13 декабря 2019 г. South African National Biodiversity Institute
Assess the occurrence and infestation rate of olive flies, olive beetles, olive lace bug and their parasitoids in wild and domestic olives in the Western Cape and to generate primary DNA sequence data. The data will include estimates of genetic diversity in olive flies, novel complete mitochondrial genomes and sequences for barcoding in six species.
Дата публикации:
13 декабря 2019 г.
Техническое обеспечение:
South African National Biodiversity Institute
Лицензия:
CC-BY 4.0

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 2 294 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Загрузки

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 2 294 Записи в English (42 kB) - Частота обновления: unknown
Метаданные в формате EML Скачать в English (9 kB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (8 kB)

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

van Asch B (2019): FBIP: Genetic diversity of olive insect pests and their natural enemies in the Western Cape. v1.0. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=marais_hbsoc_2016_adm&v=1.0

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является South African National Biodiversity Institute. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 0081d6b8-9c38-49ee-8355-f5a118cc0876.  South African National Biodiversity Institute отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке South African Biodiversity Information Facility.

Ключевые слова

Bactrocera; Argopistes; Plerochila australis; parasitoids wasps; Specimen

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Barbara van Asch
Senior Lecturer
Stellenbosch University
Stellenbosch University, Department of Genetics, JC Smuts Building Room 224
7601 Stellenbosch University
Western Cape
ZA
0218085888
http://www.sun.ac.za/english/faculty/agri/genetics/staff-students/academic-staff

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Barbara van Asch
Senior Lecturer
Stellenbosch University
Stellenbosch University, Department of Genetics, JC Smuts Building Room 224
7601 Stellenbosch University
Western Cape
ZA
0218085888
http://www.sun.ac.za/english/faculty/agri/genetics/staff-students/academic-staff

Кем заполнены метаданные:

Barbara van Asch
Senior Lecturer
Stellenbosch University
Stellenbosch University, Department of Genetics, JC Smuts Building Room 224
7601 Stellenbosch University
Western Cape
ZA
0218085888
http://www.sun.ac.za/english/faculty/agri/genetics/staff-students/academic-staff

Кто еще связан с данным ресурсом:

Content Provider
Mahlatse Kgatla
FBIP Data Specialist
SANBI
2 Cussonia Avenue, Brummeria
0184 Pretoria
Gauteng
ZA
0128435196
http://fbip.co.za/contact/

Географический охват

Western Cape, Stellenbosch

Ограничивающие координаты Юг Запад [-39,661, 7,77], Север Восток [-33,202, 26,517]

Таксономический охват

Olive Insects

Class  Insects

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2015-03-06 / 2016-05-09

Данные проекта

Assess the occurrence and infestation rate of olive flies, olive beetles, olive lace bug and their parasitoids in wild and domestic olives in the Western Cape and to generate primary DNA sequence data. The data will include estimates of genetic diversity in olive flies, novel complete mitochondrial genomes and sequences for barcoding in six species.

Название Genetic diversity of olive insect pests and their natural enemies in the Western Cape
Идентификатор FBIS150603118644
Финансирование Foundational Biodiversity Information Programme
Описание района исследования Western Cape, Stellenbosch

Исполнители проекта:

Principal Investigator
Barbara van Asch

Методы сбора

Whole animals where collected

Охват исследования Western Cape, Stellenbosch

Описание этапа методики:

  1. We propose to survey the presence, estimate infestation rate in wild and domestic olives and assess the genetic diversity of B. oleae and B. bigutulla, Argopistes spp. (A. sexvitattus, A. capensis and A. oleae) and P. australis (olive flies, olive beetles and olive lace bug, respectively) in the Western Cape of South Africa. We will generate primary sequence data on complete mitochondrial genomes for one individual of each species, and cytochrome c oxidase I (COI, the reference barcoding DNA region) for 50 individuals of each species. Complete mitogenomes will be used to reconstruct phylogenetic trees of Bactrocera spp., the Galerucinae sub-family for Argopistes spp. and the Tingidae family for Plerochila australis. Novel COI data will be generated and deposited in BOLD for barcoding purposes, accompanied by full taxonomic records. Complete mitogenomes, COI and mtDNA polymorphic regions will be used to assess intra-specific diversity in olive flies.

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=marais_hbsoc_2016_adm