FBIP: Genetic diversity of olive insect pests and their natural enemies in the Western Cape

Registros biológicos
Última versión publicado por South African National Biodiversity Institute el dic 13, 2019 South African National Biodiversity Institute
Fecha de publicación:
13 de diciembre de 2019
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

Assess the occurrence and infestation rate of olive flies, olive beetles, olive lace bug and their parasitoids in wild and domestic olives in the Western Cape and to generate primary DNA sequence data. The data will include estimates of genetic diversity in olive flies, novel complete mitochondrial genomes and sequences for barcoding in six species.

Registros

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Versiones

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¿Cómo referenciar?

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van Asch B (2019): FBIP: Genetic diversity of olive insect pests and their natural enemies in the Western Cape. v1.0. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=marais_hbsoc_2016_adm&v=1.0

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es South African National Biodiversity Institute. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 0081d6b8-9c38-49ee-8355-f5a118cc0876.  South African National Biodiversity Institute publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por South African Biodiversity Information Facility.

Palabras clave

Bactrocera; Argopistes; Plerochila australis; parasitoids wasps; Specimen

Contactos

Barbara van Asch
  • Proveedor De Los Metadatos ●
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
Senior Lecturer
Stellenbosch University
Stellenbosch University, Department of Genetics, JC Smuts Building Room 224
7601 Stellenbosch University
Western Cape
ZA
0218085888
http://www.sun.ac.za/english/faculty/agri/genetics/staff-students/academic-staff
Mahlatse Kgatla
  • Proveedor De Contenido
FBIP Data Specialist
SANBI
2 Cussonia Avenue, Brummeria
0184 Pretoria
Gauteng
ZA
0128435196
http://fbip.co.za/contact/

Cobertura geográfica

Western Cape, Stellenbosch

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-39,661, 7,77], Latitud Máxima Longitud Máxima [-33,202, 26,517]

Cobertura taxonómica

Olive Insects

Class Insects

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2015-03-06 / 2016-05-09

Datos del proyecto

Assess the occurrence and infestation rate of olive flies, olive beetles, olive lace bug and their parasitoids in wild and domestic olives in the Western Cape and to generate primary DNA sequence data. The data will include estimates of genetic diversity in olive flies, novel complete mitochondrial genomes and sequences for barcoding in six species.

Título Genetic diversity of olive insect pests and their natural enemies in the Western Cape
Identificador FBIS150603118644
Fuentes de Financiación Foundational Biodiversity Information Programme
Descripción del área de estudio Western Cape, Stellenbosch

Personas asociadas al proyecto:

Barbara van Asch
  • Investigador Principal

Métodos de muestreo

Whole animals where collected

Área de Estudio Western Cape, Stellenbosch

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. We propose to survey the presence, estimate infestation rate in wild and domestic olives and assess the genetic diversity of B. oleae and B. bigutulla, Argopistes spp. (A. sexvitattus, A. capensis and A. oleae) and P. australis (olive flies, olive beetles and olive lace bug, respectively) in the Western Cape of South Africa. We will generate primary sequence data on complete mitochondrial genomes for one individual of each species, and cytochrome c oxidase I (COI, the reference barcoding DNA region) for 50 individuals of each species. Complete mitogenomes will be used to reconstruct phylogenetic trees of Bactrocera spp., the Galerucinae sub-family for Argopistes spp. and the Tingidae family for Plerochila australis. Novel COI data will be generated and deposited in BOLD for barcoding purposes, accompanied by full taxonomic records. Complete mitogenomes, COI and mtDNA polymorphic regions will be used to assess intra-specific diversity in olive flies.

Metadatos adicionales