Occurrence

FBIP: Genetic diversity of olive insect pests and their natural enemies in the Western Cape

Dernière version Publié par South African National Biodiversity Institute le 13 décembre 2019 South African National Biodiversity Institute
Assess the occurrence and infestation rate of olive flies, olive beetles, olive lace bug and their parasitoids in wild and domestic olives in the Western Cape and to generate primary DNA sequence data. The data will include estimates of genetic diversity in olive flies, novel complete mitochondrial genomes and sequences for barcoding in six species.
Date de publication:
13 décembre 2019
Licence:
CC-BY 4.0

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 2 294 enregistrements.

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Téléchargements

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Versions

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Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

van Asch B (2019): FBIP: Genetic diversity of olive insect pests and their natural enemies in the Western Cape. v1.0. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=marais_hbsoc_2016_adm&v=1.0

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est South African National Biodiversity Institute. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 0081d6b8-9c38-49ee-8355-f5a118cc0876.  South African National Biodiversity Institute publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du South African Biodiversity Information Facility.

Mots-clé

Bactrocera; Argopistes; Plerochila australis; parasitoids wasps; Specimen

Contacts

Personne ayant créé cette ressource:

Barbara van Asch
Senior Lecturer
Stellenbosch University
Stellenbosch University, Department of Genetics, JC Smuts Building Room 224
7601 Stellenbosch University
Western Cape
ZA
0218085888
http://www.sun.ac.za/english/faculty/agri/genetics/staff-students/academic-staff

Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:

Barbara van Asch
Senior Lecturer
Stellenbosch University
Stellenbosch University, Department of Genetics, JC Smuts Building Room 224
7601 Stellenbosch University
Western Cape
ZA
0218085888
http://www.sun.ac.za/english/faculty/agri/genetics/staff-students/academic-staff

Personne ayant renseigné les métadonnées:

Barbara van Asch
Senior Lecturer
Stellenbosch University
Stellenbosch University, Department of Genetics, JC Smuts Building Room 224
7601 Stellenbosch University
Western Cape
ZA
0218085888
http://www.sun.ac.za/english/faculty/agri/genetics/staff-students/academic-staff

Autres personnes associées à la ressource:

Fournisseur de Contenu
Mahlatse Kgatla
FBIP Data Specialist
SANBI
2 Cussonia Avenue, Brummeria
0184 Pretoria
Gauteng
ZA
0128435196
http://fbip.co.za/contact/

Couverture géographique

Western Cape, Stellenbosch

Enveloppe géographique Sud Ouest [-39,661, 7,77], Nord Est [-33,202, 26,517]

Couverture taxonomique

Olive Insects

Class  Insects

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2015-03-06 / 2016-05-09

Données sur le projet

Assess the occurrence and infestation rate of olive flies, olive beetles, olive lace bug and their parasitoids in wild and domestic olives in the Western Cape and to generate primary DNA sequence data. The data will include estimates of genetic diversity in olive flies, novel complete mitochondrial genomes and sequences for barcoding in six species.

Titre Genetic diversity of olive insect pests and their natural enemies in the Western Cape
Identifiant FBIS150603118644
Financement Foundational Biodiversity Information Programme
Description du domaine d'étude / de recherche Western Cape, Stellenbosch

Les personnes impliquées dans le projet:

Chercheur Principal
Barbara van Asch

Méthodes d'échantillonnage

Whole animals where collected

Etendue de l'étude Western Cape, Stellenbosch

Description des étapes de la méthode:

  1. We propose to survey the presence, estimate infestation rate in wild and domestic olives and assess the genetic diversity of B. oleae and B. bigutulla, Argopistes spp. (A. sexvitattus, A. capensis and A. oleae) and P. australis (olive flies, olive beetles and olive lace bug, respectively) in the Western Cape of South Africa. We will generate primary sequence data on complete mitochondrial genomes for one individual of each species, and cytochrome c oxidase I (COI, the reference barcoding DNA region) for 50 individuals of each species. Complete mitogenomes will be used to reconstruct phylogenetic trees of Bactrocera spp., the Galerucinae sub-family for Argopistes spp. and the Tingidae family for Plerochila australis. Novel COI data will be generated and deposited in BOLD for barcoding purposes, accompanied by full taxonomic records. Complete mitogenomes, COI and mtDNA polymorphic regions will be used to assess intra-specific diversity in olive flies.

Métadonnées additionnelles