Occurrence

FBIP: What are the impacts of global climate change on arid soil microbial communities?

Dernière version Publié par South African National Biodiversity Institute le 30 juin 2020 South African National Biodiversity Institute
A broad survey of microbial (bacteria, archaea, fungi and protista) communities along a West-East aridity gradient across South Africa.
Date de publication:
30 juin 2020
Licence:
CC-BY 4.0

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 3 986 enregistrements.

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Téléchargements

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Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Makhalanyane T (2020): FBIP: What are the impacts of global climate change on arid soil microbial communities?. v1.1. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=what&v=1.1

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est South African National Biodiversity Institute. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : a387a0b3-7cf8-4d73-8851-eccbd882e16d.  South African National Biodiversity Institute publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du South African Biodiversity Information Facility.

Mots-clé

Occurrence; Specimen

Contacts

Personne ayant créé cette ressource:

Thulani Makhalanyane
Lecturer
University of Pretoria
Natural Sciences 2, Office 3-14, Hatfied Campus, Lynwood Road
0028 Pretoria
Gauteng
ZA
012 4206976

Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:

Thulani Makhalanyane
Lecturer
University of Pretoria
Natural Sciences 2, Office 3-14, Hatfied Campus, Lynwood Road
0028 Pretoria
Gauteng
ZA
012 4206976

Personne ayant renseigné les métadonnées:

Thulani Makhalanyane
Lecturer
University of Pretoria
Natural Sciences 2, Office 3-14, Hatfied Campus, Lynwood Road
0028 Pretoria
Gauteng
ZA
012 4206976

Autres personnes associées à la ressource:

Fournisseur de Contenu
Mahlatse Kgatla
FBIP Data Specialist
SANBI
2 Cussonia Avenue
0184 Pretoria
Gauteng
ZA
0128435196
http://fbip.co.za/contact/

Couverture géographique

South Africa (Northern Cape, KwaZulu Natal, Free State)

Enveloppe géographique Sud Ouest [-34,814, 16,348], Nord Est [-24,807, 29,839]

Couverture taxonomique

A broad survey of microbial (bacteria, archaea, fungi and protista) communities along a West-East aridity gradient across South Africa.

Kingdom  Fungi,  Archaea,  Bacteria,  Protista

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2016-02-19 / 2016-02-23

Données sur le projet

A broad survey of microbial (bacteria, archaea, fungi and protista) communities along a West-East aridity gradient across South Africa.

Titre What are the impacts of global climate change on arid soil microbial communities?
Identifiant FBIS150516118075
Financement Foundational Biodiversity Information Programme
Description du domaine d'étude / de recherche South Africa (Northern Cape, KwaZulu Natal, Free State)

Les personnes impliquées dans le projet:

Chercheur Principal
Thulani Makhalanyane

Méthodes d'échantillonnage

Whole animals where collected

Etendue de l'étude South Africa (Northern Cape, KwaZulu Natal, Free State)

Description des étapes de la méthode:

  1. Samples will be collected during a field campaign in early 2016, along an aridity gradient (Figure 1: Attachment). The aridity gradient will be sampled from a single lithostratigraphic group (Volksrust Group) to minimise variation due to geology. The landform stretches from West to East across central South Africa, and experiences rainfall, which ranges from approximately 100 mm p.a. to 1000 mm p.a. It mainly runs through the Nama Karoo and the Grassland biomes. One hundred and sixty sampling sites will be selected at regular intervals across the rainfall gradient. These will be identified with the help of national spatial datasets to ensure that the aridity gradient is evenly sampled. Best estimates of annual rainfall for each collecting site will be extracted from national climatological datasets. DNA from the soil samples will be extracted using well-established protocols (13), and subjected to amplicon sequencing analysis as specified in WP 2 (see detailed below). In order to obtain phylogenetic information, tagged amplicon pyrosequencing will be done using known markers. Soil chemistry and respiration assays will be conducted (see detailed below) in order to quantify the levels of carbon along the aridity gradient.

Métadonnées additionnelles