FBIP: What are the impacts of global climate change on arid soil microbial communities?

Registros biológicos
Última versión publicado por South African National Biodiversity Institute el jun. 30, 2020 South African National Biodiversity Institute
Fecha de publicación:
30 de junio de 2020
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

A broad survey of microbial (bacteria, archaea, fungi and protista) communities along a West-East aridity gradient across South Africa.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 3.986 registros.

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

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Makhalanyane T (2020): FBIP: What are the impacts of global climate change on arid soil microbial communities?. v1.1. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=what&v=1.1

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es South African National Biodiversity Institute. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: a387a0b3-7cf8-4d73-8851-eccbd882e16d.  South African National Biodiversity Institute publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por South African Biodiversity Information Facility.

Palabras clave

Occurrence; Specimen

Contactos

Thulani Makhalanyane
  • Proveedor De Los Metadatos ●
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
Lecturer
University of Pretoria
Natural Sciences 2, Office 3-14, Hatfied Campus, Lynwood Road
0028 Pretoria
Gauteng
ZA
012 4206976
Mahlatse Kgatla
  • Proveedor De Contenido
FBIP Data Specialist
SANBI
2 Cussonia Avenue
0184 Pretoria
Gauteng
ZA
0128435196
http://fbip.co.za/contact/

Cobertura geográfica

South Africa (Northern Cape, KwaZulu Natal, Free State)

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-34,814, 16,348], Latitud Máxima Longitud Máxima [-24,807, 29,839]

Cobertura taxonómica

A broad survey of microbial (bacteria, archaea, fungi and protista) communities along a West-East aridity gradient across South Africa.

Reino Fungi, Archaea, Bacteria, Protista

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2016-02-19 / 2016-02-23

Datos del proyecto

A broad survey of microbial (bacteria, archaea, fungi and protista) communities along a West-East aridity gradient across South Africa.

Título What are the impacts of global climate change on arid soil microbial communities?
Identificador FBIS150516118075
Fuentes de Financiación Foundational Biodiversity Information Programme
Descripción del área de estudio South Africa (Northern Cape, KwaZulu Natal, Free State)

Personas asociadas al proyecto:

Thulani Makhalanyane
  • Investigador Principal

Métodos de muestreo

Whole animals where collected

Área de Estudio South Africa (Northern Cape, KwaZulu Natal, Free State)

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Samples will be collected during a field campaign in early 2016, along an aridity gradient (Figure 1: Attachment). The aridity gradient will be sampled from a single lithostratigraphic group (Volksrust Group) to minimise variation due to geology. The landform stretches from West to East across central South Africa, and experiences rainfall, which ranges from approximately 100 mm p.a. to 1000 mm p.a. It mainly runs through the Nama Karoo and the Grassland biomes. One hundred and sixty sampling sites will be selected at regular intervals across the rainfall gradient. These will be identified with the help of national spatial datasets to ensure that the aridity gradient is evenly sampled. Best estimates of annual rainfall for each collecting site will be extracted from national climatological datasets. DNA from the soil samples will be extracted using well-established protocols (13), and subjected to amplicon sequencing analysis as specified in WP 2 (see detailed below). In order to obtain phylogenetic information, tagged amplicon pyrosequencing will be done using known markers. Soil chemistry and respiration assays will be conducted (see detailed below) in order to quantify the levels of carbon along the aridity gradient.

Metadatos adicionales