Registros de Dados
Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 108 registros.
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Versões
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Como citar
Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:
Oosthuizen M (2020): FBIP: Cataloguing zoonotic tick-borne bacterial pathogen strain diversity in wild rodent species in rural South Africa. v1.0. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=fbip2&v=1.0
Direitos
Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:
O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é South African National Biodiversity Institute. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.
GBIF Registration
Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: eb8708e4-5788-4c44-89c9-ef54e4423086. South African National Biodiversity Institute publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por South African Biodiversity Information Facility.
Palavras-chave
Occurrence; Specimen
Contatos
Quem criou esse recurso:
Quem pode responder a perguntas sobre o recurso:
Quem preencher os metadados:
Quem mais foi associado com o recurso:
Cobertura Geográfica
South Africa (Mpumalanga)
Coordenadas delimitadoras | Sul Oeste [-24,827, 31,33], Norte Leste [-24,617, 32,371] |
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Cobertura Taxonômica
Catalogue the tick-borne bacterial pathogen strain diversity present in wild rodent species
Gênero | Anaplasma (Bacteria), Mastomys (Rodents) |
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Cobertura Temporal
Data Inicial / Data final | 2012-04-01 / 2016-04-05 |
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Dados Sobre o Projeto
The aim of the study is, therefore, to catalogue the tick-borne bacterial pathogen strain diversity present in wild rodent species in the Mnisi community that could impact human health by using a metagenomics approach.
Título | FBIP: Cataloguing zoonotic tick-borne bacterial pathogen strain diversity in wild rodent species in rural South Africa |
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Identificador | FBIS170330225236 |
Financiamento | Foundational Biodiversity Information Programme |
Descrição da Área de Estudo | South Africa (Mpumalanga) |
O pessoal envolvido no projeto:
Métodos de Amostragem
-Ethical clearance through the Animal Ethics Committee (AEC) of the University of Pretoria was obtained (V046-14 and V030-14). -302 rodent blood samples across three habitat types (urban/periurban, communal rangelands, adjacent protected rangeland areas) in Mnisi has already been collected. Further Trapping will be done using Sherman-type traps; five sites will be pre-selected per habitat type; 50 traps will be used/site for up to 5 consecutive days. Traps will be baited with peanut butter, oats and marmite, checked twice/day. We aim to trap at least 15-20 individuals of 10 main species of rodents in each of the habitat types (n=600). Targeted species will be euthanized, blood will be collected immediately after euthanasian by cardiocentesis. Carcasses will be placed individually in sealed plastic bags and frozen.
Área de Estudo | South Africa (Mpumalanga) in Mnisi |
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Controle de Qualidade | NA |
Descrição dos passos do método:
- -Apart from identifying rodent species by means of the Stuarts’ Field Guide to Mammals of Southern Africa (Stuart & Stuart, 2001), species verification will be done using sequence analysis of the mitochondrial gene Cytochrome Oxidase I (COI) -Catalogue the occurrence of the tick-borne bacterial pathogens present in wild rodent species by DNA analysis of the rodent microbiome. -Establish the genetic diversity of A. phagocytophilum strains by using specific gene markers.
Metadados Adicionais
Identificadores alternativos | http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=fbip2 |
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