Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 108 записей.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Загрузки
Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Oosthuizen M (2020): FBIP: Cataloguing zoonotic tick-borne bacterial pathogen strain diversity in wild rodent species in rural South Africa. v1.0. South African National Biodiversity Institute. Dataset/Occurrence. http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=fbip2&v=1.0
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является South African National Biodiversity Institute. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: eb8708e4-5788-4c44-89c9-ef54e4423086. South African National Biodiversity Institute отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке South African Biodiversity Information Facility.
Ключевые слова
Occurrence; Specimen
Контакты
Кто является создателем ресурса:
Кто может ответить на вопросы о ресурсе:
Кем заполнены метаданные:
Кто еще связан с данным ресурсом:
Географический охват
South Africa (Mpumalanga)
Ограничивающие координаты | Юг Запад [-24,827, 31,33], Север Восток [-24,617, 32,371] |
---|
Таксономический охват
Catalogue the tick-borne bacterial pathogen strain diversity present in wild rodent species
Genus | Anaplasma (Bacteria), Mastomys (Rodents) |
---|
Временной охват
Дата начала / Дата окончания | 2012-04-01 / 2016-04-05 |
---|
Данные проекта
The aim of the study is, therefore, to catalogue the tick-borne bacterial pathogen strain diversity present in wild rodent species in the Mnisi community that could impact human health by using a metagenomics approach.
Название | FBIP: Cataloguing zoonotic tick-borne bacterial pathogen strain diversity in wild rodent species in rural South Africa |
---|---|
Идентификатор | FBIS170330225236 |
Финансирование | Foundational Biodiversity Information Programme |
Описание района исследования | South Africa (Mpumalanga) |
Исполнители проекта:
Методы сбора
-Ethical clearance through the Animal Ethics Committee (AEC) of the University of Pretoria was obtained (V046-14 and V030-14). -302 rodent blood samples across three habitat types (urban/periurban, communal rangelands, adjacent protected rangeland areas) in Mnisi has already been collected. Further Trapping will be done using Sherman-type traps; five sites will be pre-selected per habitat type; 50 traps will be used/site for up to 5 consecutive days. Traps will be baited with peanut butter, oats and marmite, checked twice/day. We aim to trap at least 15-20 individuals of 10 main species of rodents in each of the habitat types (n=600). Targeted species will be euthanized, blood will be collected immediately after euthanasian by cardiocentesis. Carcasses will be placed individually in sealed plastic bags and frozen.
Охват исследования | South Africa (Mpumalanga) in Mnisi |
---|---|
Контроль качества | NA |
Описание этапа методики:
- -Apart from identifying rodent species by means of the Stuarts’ Field Guide to Mammals of Southern Africa (Stuart & Stuart, 2001), species verification will be done using sequence analysis of the mitochondrial gene Cytochrome Oxidase I (COI) -Catalogue the occurrence of the tick-borne bacterial pathogens present in wild rodent species by DNA analysis of the rodent microbiome. -Establish the genetic diversity of A. phagocytophilum strains by using specific gene markers.
Дополнительные метаданные
Альтернативные идентификаторы | http://ipt.sanbi.org.za/iptsanbi/resource?r=fbip2 |
---|